Hematoonkologické oddělení
Oddělení dětské hematologie
je součástí Kliniky dětské hematologie a onkologie FN Motol. Skládá se ze dvou lůžkových oddělení, jednotky pro transplantaci kostní dřeně, stacionáře pro děti v intenzivní ambulantní léčbě a laboratoře molekulární genetiky. Z lůžkových oddělení je jedno vyčleněno pro pacienty vyžadující intenzivní péči a má 10 lůžek, druhé oddělení s 15 lůžky zajišťuje standardní péči. Na oddělení jsou hospitalizovány děti s krevními onemocněními z Prahy a středních Čech a některá vzácná onemocnění z celé České republiky. Největší počet pacientů je zde léčen pro různé formy leukémie, další relativně častou diagnózou je selhání kostní dřeně (aplastická anemie) - pacienti s touto diagnózou jsou soustřeďováni z celé republiky. Ročně je přijímáno více než 30 nových případů dětské leukémie, jejíž léčba trvá přibližně 2 roky. Pobyt rodičů s nemocnými dětmi na oddělení je samozřejmostí. Součástí oddělení je také hemofilické centrum, kde jsou převážně ambulantní formou sledováni chlapci trpící vzácnou poruchou srážení krve - hemofilií. Ve sledování kliniky je jich více než 50. Těmto dětem je ve FN Motol poskytována komplexní zdravotní péče ortopedická, stomatologická, rehabilitační atd. V úzké spolupráci s Oddělením klinické hematologie FN Motol zajišťují pracovníci hematologického oddělení ambulantní vyšetřování dětí s krevními onemocněními z Prahy a středních Čech na motolské poliklinice.
Jednotka pro transplantaci kostní dřeně
Transplantační jednotka zahájila svou činnost v roce 1989. Jedná se o jediné zařízení svého druhu pro děti z celé České republiky, kde se provádí alogenní transplantace kostní dřeně (transplantace od zdravých dárců - sourozenců, jiných rodinných příslušníků nebo nepříbuzných dárců z registru). Na jednotce jsou léčeny zejména děti s leukémií, ale i jinými onemocněními, jako jsou vrozené těžké poruchy obranyschopnosti, metabolické vady, aplastické anemie apod. Každoročně tento náročný léčebný zákrok podstoupí přibližně 25 dětí, které jsou vždy hospitalizovány se svými rodiči a stráví na jednotce obvykle několik měsíců. Jednotka se 6 lůžky, z toho 4 v chráněném prostředí s filtry vzduchu, od svého vzniku pracovala v provizorním prostředí adaptovaného normálního oddělení a koncem 90 let byla již ve velmi špatném technickém stavu. V roce 2000 se s velkým přispěním Nadačního fondu Kapka naděje a občanských sdružení Život dětem a HAIMA podařilo získat od Ministerstva zdravotnictví finanční prostředky na stavbu nové moderní transplantační jednotky s 10 plně klimatizovanými lůžky, jejíž provoz byl zahájen v březnu 2003.
Laboratoř molekulární genetiky
provádí velmi specializovanou diagnostiku dětské leukémie pro celou Českou republiku, která je nutná pro správnou léčbu tohoto nejčastějšího zhoubného nádorového onemocnění v dětském věku. Je zde prováděn i výzkum zaměřený na odhalení faktorů vedoucích ke vzniku leukémie. Laboratoř vznikla s pomocí sponzorského finančního daru, svůj provoz částečně hradí z prostředků zdravotních pojišťoven a grantových prostředků Ministerstva zdravotnictví, neobejde se ale bez sponzorských příspěvků, jaký poskytla například Kapka naděje v roce 2000 na nákup velmi drahého přístroje určeného pro výzkum dětské leukémie.